בחירת אריזת בקבוקי שמן אתרים קשורה ישירות לאיכות האחסון, הנוחות והבטיחות של שמנים אתריים. הבחירה המומלצת ביותר היא חומר זכוכית כהה (כגון חום, ירוק כהה) עם מבנה פקק בקבוק-אטום היטב, בשילוב עם-הוכחת אור,-הוכחה, נגד-זיופים ועיצובים אחרים כדי להבטיח שהשמן האתרי יישאר יציב ופעיל במהלך הובלה ושימוש.
